使用Geneious快速定位基因魔剪CRISPR/cas的gRNA位点与脱靶结合位点[1]
基于机器学习，仅供参考。
介绍
CRISPR / Cas9系统是用于基因编辑的RNA引导核酸内切酶技术。该系统需要包含与PAM（Protospacer Adjacent Motif）位点相邻的20bp靶序列的指导RNA（gRNA），以将Cas9核酸内切酶引导至切割位点。Geneious中的Find CRISPR位点工具将搜索所选基因中的gRNA（“CRISPR”）位点，并在您感兴趣的基因组中搜索脱靶结合位点。选定序列中的每个CRISPR位点根据它可能会绑定到多少个脱离目标位点以及脱离目标位点与原始序列的相似程度进行评分。
在本教程中，您将使用来自酿酒酵母 S288c 的LYP1 CDS 和使用S288c基因组作为脱靶数据库。LYP1或赖氨酸通透酶在酵母基因组的14号染色体上发现。它是负责摄取阳离子氨基酸的三种氨基酸通透酶之一（Alp1p，Can1p，Lyp1p）。有关此基因的更多信息，请点击https://www.yeastgenome.org/。
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